Genų mutacijų lentelė

Mutacijų tyrimų lentelė

 

  Liga

Tiriamos mutacijos 
 Kurtumas 3 mutacijos 35delG, 310del14, IVS+1G>A  GJB2 gene
 
 Epidermolysis bullosa mutacijos gene COL7A1
 Dermatitis atopica mutacijos R501X ir c.2282del4 gene FLG
 Celiakija mutacija HLA DQ2/DQ*
 Žilbero sindromas (TA)n gene UGT1A1
 Hemochromatozė 2 mutacijos C282Y ir H63D gene HFE
 Laktozes  netoleravimas polimorfizmas 13910 C>T gene LCT
 Pankreatitas 12 mutacijų gene PRSS1
 Wilsono liga mutacija H1069Q gene ATP7B
 
 Savaiminiai    persileidimai ar  nesivystantys nėštumai  (2 ir >), nevaisingumas kariotipas (2-jų partnerių)
 Savaiminis    persileidimas mutacija gene F5 (Leiden- faktorius V) + mutacija 20210G>A gene F2 (protrombino faktoriaus-II)
mutacijos gene SCARB1 (<progesteronas)
 Hiperadrogenizmas delecija gene UGT2B17
 Įgimtas kiaušidžių  defektas POF   (premature ovarian  failure) (CGG)n ekspansija FMR1 gene
 
 Vyrų nevaisingumas 319 mutacijų gene CFTR (tarp jų 8 dažniausios: F508del, R117H, CFTRdele2,3, G551D, G542X, R553X, IVS8-T+(TG)n, D1152)
 Azoospermija mikrodelecijos regione AZF, chromosomoje Y (6 loci)
 Vyrų nevaisingumas Panelis: kariotipas+CFTR+AZF
 Trombocitopenija mutacijos gene MASTL ir gene ANKRD26
Trombofilija mutacija gene F5 (Leiden- faktorius V)
F2 (protrombino – faktorius II)
MTHFR
Panelis: F5+F2+MTHFR
 
 Celiakija mutacija HLA DQ2/DQ*
 Hiper-IgE sindromas mutacijos gene STAT3
 Reumatoidinis artritas antigenas HLA-B27
 
 Andersen-Tawil  sindromas, Long QT mutacijos 2 egzone geno KCNJ2
 Hipercholesterolemija 4 mutacijos gene ApoB
mutacija gene LDLR
Panelis: ApoB+LDLR
 Predispozicija širdies  infarktui mutacija R952Q gene LRP8 ir CYP1A2*1F
  Trombofilija mutacija gene F5 (Leiden- faktorius V)
F2 (protrombino – faktorius II)
MTHFR
Panelis: F5+F2+MTHFR
  R408 W mutacija PAH gene
R408W, R158Q, c.1315+1G>5, c. 1066-11G>A ir kitos retos mutacijos egzone 5,11 ir 12 gene PAH
 Fruktozemija 2 mutacijos: A150P ir A175 D gene ALDOB (su galimybe nustatyti retas mutacijas)
 Galaktozemija  egzonai 6, 7, 8, 9,  mutacijos Q188R ir K285 R gene GALT
 Osteoporozė mutacijos gene Vitamono D receptoriaus
  mutacijos gene kalcio  receptoriaus
 Smith-Lemli-Opitz  sindromas p. Trp 151 X, p. Vel 326 Leu, p. Leu 157 Pro, p. Arg 353 Trp, IVS8-1G>C, p.Arg 446 Gln   gene DHCR
 
Alzheimerio liga mutacijos E2, E3, E4 (112, 158) gene ApoE
mutacijos T714A ir V715A gene beta-APP
mutacijos P117R, M139V, H163R, I213F gene PSEN1
mutacija Q228L gene PSEN2
panelis: ApoE+beta-APP+PSEN1+PSEN2
Angelmano sindromas metiliacijos testas
hibridizacija
Essential tremor (ET) mutacijos gene DRD3
Fragilos X chromosomos sindromas (CGG)n ekspansija FMR1 gene- I etapas (skriningas)
Fragilos X chromosomos sindromas hibridizacija
Friedreicho ataksija mutacijos gene FXN
Hantingtono liga (CAG)n ekspansija gene IT
Prader-Willi sidromas metilacijos testas
Retto sindromas muracijos egzone 3 ir 4 geno MECP2
 SMA (diagnostinis  testas) Delecijų (egzone 7) SMN 1 geno nustatymas
 SMA (giminių testas) Delecijų (egzone 7) SMN 1 geno nustatymas
 
 Prostata, plaučiai,  žarnynas mutacijos gene KRAS (terapiniam tikslui)
  mutacijos gene BRAF  (terapiniam tikslui)
  mutacijos gene HRAS  (terapiniam tikslui)
  Panelis: KRAS+BRAF+HRAS  (terapiniam tikslui)
 Plaučiai  mutacijos (egzonas 19: del746-752; egzonas 21:L858R)  gene EGFR  (terapiniam tikslui)
 Šeiminė adenomatozinė  polipozė FAP(familial  adenomatous poliposis) I etapas APC geno tyrimo
 Leukemija, policitemija mutacija V617F gene JAK2
 Krūtis, kiaušidės, gimda,  prostata 3 mutacijos gene BRCA1 (5382insC, 4153delA, 300T/G)
1 mutacjija gene BRCA2
 Krūtis, kiaušidės,  inkstai, plaučiai,  žarnynas, skydliaukė,  prostata  (susirgimas  >50 metu) 3 mutacijos gene CHEK2 (I157T, 1100delC, IVS2+1G>A)
 Krutis, kiausides,  inkstai, plauciai,  zarnynas, skydliaues,  prostata  (susirgimas  >50 metu) 1 mutacija gene CHEK2 (del5395)
 Nijmegen sindromas mutacija c.657_661del5(p.Lys219AsnfsX15) gene NBS1
 
 Achondroplasia mutacija p.G380R (G>A ir G>C) gene FGFR3
 Hipochondroplasia mutacija c.1620C>A ir c.1620C>G gene FGFR3
 Freeman-Sheldon  sindromas mutacijos R672C ir R672H gene MYH3
 McCune-Albright  sindromas mutacijos 565delCTGA ir R210H egzonie 7 geno GNAS
 Milibrey nanism  sindromas mutacija c.493-2A>G gene  TRIM37
 Tanatoforic dysplasia eksonas 7
 Tanatoforic dysplasia eksonas 8
 
  Kariotipo nustatymas iš periferinio kraujo limfocitų
 
 Mental retardation+  dysmprphic syndrome MLPA subtelomerinis testas (daromas jeigu kariotipas normalus ir Fra(X) negatyvus)
 Testas diagnozuoja apie  20  mikrodelecinių  sindromų  MLPA mikrodelecinis testas
Testas diagnozuoja labai mažas submikroskopinės chromosominės aberacijos arrayCGH